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PCR反應條件溫度與時間設置

日期:2025-04-23 11:00
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摘要: PCR反應條件的選擇技巧主要體現(xiàn)在溫度、時間和循環(huán)次數(shù)上,溫度過高,延伸時間不夠都會對實驗結果有很大的影響,下面詳細了解: 1、變性溫度與時間 變性溫度低,解鏈不*是導致PCR失敗的zui 主要原因。一般情況下,93℃~94℃lmin足以使模板DNA變性,若低于93℃則需延長時間,但溫度不能過高,因為高溫環(huán)境對酶的活性有影響。此步若不能使靶基因模板或PCR產(chǎn)物*變性,就會導致PCR失敗。 2、延伸溫度與時間 Taq DNA聚合酶的生物學活性: 70~80℃ 150核苷酸/S/酶分子 70℃ 60核苷酸...

PCR反應條件的選擇技巧主要體現(xiàn)在溫度、時間和循環(huán)次數(shù)上,溫度過高,延伸時間不夠都會對實驗結果有很大的影響,下面詳細了解:

1、變性溫度與時間

 
變性溫度低,解鏈不*是導致PCR失敗的zui 主要原因。一般情況下,93℃~94℃lmin足以使模板DNA變性,若低于93℃則需延長時間,但溫度不能過高,因為高溫環(huán)境對酶的活性有影響。此步若不能使靶基因模板或PCR產(chǎn)物*變性,就會導致PCR失敗。
 
2、延伸溫度與時間
 
Taq DNA聚合酶的生物學活性:
 
70~80℃ 150核苷酸/S/酶分子
 
70℃ 60核苷酸/S/酶分子
 
55℃ 24核苷酸/S/酶分子
 
高于90℃時, DNA合成幾乎不能進行。
 
PCR反應的延伸溫度一般選擇在70~75℃之間,常用溫度為72℃,過高的延伸溫度不利于引物和模板的結合。PCR延伸反應的時間,可根據(jù)待擴增片段的長度而定,一般1Kb以內(nèi)的DNA片段,延伸時間1min是足夠的。3~4kb的靶序列需3~4min;擴增10Kb需延伸至15min。延伸進間過長會導致非特異性擴增帶的出現(xiàn)。對低濃度模板的擴增,延伸時間要稍長些。
 
3、退火(復性)溫度與時間
 
退火溫度是影響PCR特異性的較重要因素。變性后溫度快速冷卻至40℃~60℃,可使引物和模板發(fā)生結合。由于模板DNA 比引物復雜得多,引物和模板之間的碰撞結合機會遠遠高于模板互補鏈之間的碰撞。退火溫度與時間,取決于引物的長度、堿基組成及其濃度,還有靶基序列的長度。對于20個核苷酸,G+C含量約50%的引物,55℃為選擇zui 適退火溫度的起點較為理想。引物的復性溫度可通過以下公式幫助選擇合適的溫度:
 
Tm值(解鏈溫度)=4(G+C)+2(A+T)
 
復性溫度=Tm值-(5~10℃)
 
在Tm值允許范圍內(nèi), 選擇較高的復性溫度可大大減少引物和模板間的非特異性結合,提高PCR反應的特異性。復性時間一般為30~60sec,足以使引物與模板之間*結合。
 
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